Σε ένα κόσμο γεμάτο με τρελούς επιστήμονες και εφευρέτες με πρόθεση το κακό, ένας ταλαντούχος καμπούρης βοηθός εργαστηρίου, ο Igor, έχει μεγάλα όνειρα να γίνει επιστήμονας του εαυτού του και να κερδίσει το ετήσιο βραβείο Evil Science Fair. Δυστυχώς ο υπόλοιπος κόσμος των επιστημόνων δεν θα αφήσει τον Igor να τα καταφέρει.
Ένα ψαράκι-κλόουν ονόματι Marlin που ζει στο Great Barrier Reef χάνει ο γιο του Nemo, αφού ο μικρός επιχείρησε να ταξιδέψει στην ανοιχτή θάλασσα χωρίς να ακούσει τις τον πατέρα του που του ανέφερε συνεχώς τους κινδύνους. Ο Nemo πιάστηκε στα δίχτυα μιας βάρκας και κατέληξε στο ενυδρείο ενός οδοντιάτρου στο Σύδνεϋ. Ενώ ο Marlin ψάχνει τον γιο του, ο Nemo γνωρίζει την Dory, ένα μπλε ψάρι, που θα το βοηθήσει να γυρίσει πίσω. Ένα ταξίδι όλο περιπέτειες και κινδύνους.