Στο αντικείμενο του Π.Μ.Σ. περιλαμβάνονται οι επιστημονικές ενότητες που αφορούν στην πρωτογενή παραγωγή, κυρίως ζωικών προϊόντων από υδρόβιους οργανισμούς. Το Π.Μ.Σ. παρέχει στους φοιτητές ολοκληρωμένες γνώσεις, μεθόδους και τεχνικές με τις οποίες καθίστανται ικανοί επιστήμονες για την επίτευξη τόσο της άμεσης διεύρυνσης των γνώσεων, η εφαρμογή της οποίας θα προάγει τη βελτίωση των συνθηκών ελεγχόμενης παραγωγής υδρόβιων οργανισμών, όσο και της μελλοντικής αξιοποίησής τους.
Στο Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών γίνονται δεκτοί ως υποψήφιοι Πτυχιούχοι του Γεωπονικού Πανεπιστημίου Αθηνών και άλλων Γεωπονικών Τμημάτων της Χώρας, Πτυχιούχοι τριτοβάθμιας εκπαίδευσης της χώρας, κυρίως θετικής κατεύθυνσης, Πτυχιούχοι ομοταγών Τμημάτων της αλλοδαπής συναφών ειδικοτήτων, εφόσον έχουν τύχει αναγνώρισης από το ΔΟΑΤΑΠ, Απόφοιτοι ΤΕΙ συναφών ειδικοτήτων.