Το Τμήμα Ιστορίας και Αρχαιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Βυζαντινές Σπουδές» με κατευθύνσεις
Στο ΠΜΣ γίνονται δεκτοί πτυχιούχοι Τμημάτων Φιλολογίας, Ιστορίας - Αρχαιολογίας, Φιλοσοφικών και Κοινωνικών Σπουδών πανεπιστημίων της ημεδαπής ή της αλλοδαπής. Επίσης για την κατεύθυνση της Βυζαντινής Αρχαιολογίας και Ιστορίας της Βυζαντινής Τέχνης γίνονται δεκτοί και πτυχιούχοι από ελληνικά ή ξένα Α.Ε.Ι. των Τμημάτων Κοινωνικής Ανθρωπολογίας και Αρχιτεκτονικής, ενώ στην κατεύθυνση της Βυζαντινής Ιστορίας γίνονται δεκτοί και πτυχιούχοι Κοινωνικής Ανθρωπολογίας.