Το Τμήμα Ιστορίας οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) με τίτλο «Ιστορίας της Πόλης και Κτιριοδομίας μετά τον 16ο Αιώνα»με κατευθύνσεις
Στο Π.Μ.Σ. γίνονται δεκτοί πτυχιούχοι των τμημάτων Ιστορίας, Ιστορίας και Αρχαιολογίας ή ομοταγών τμημάτων των Α.Ε.Ι. της ημεδαπής ή αντίστοιχων τμημάτων της αλλοδαπής. Εκτός των παραπάνω κατηγοριών γίνονται δεκτοί και πτυχιούχοι Αρχιτέκτονες και Πολιτικοί Μηχανικοί