Το Τμήμα Κοινωνιολογίας του Πανεπιστημίου Αιγαίου οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) με τίτλο "Πόλη και Περιβάλλον. Εφαρμοσμένη και Κλινική Κοινωνιολογία".
Δεκτοί στο ΠΜΣ γίνονται Πτυχιούχοι ΑΕΙ Σχολών Κοινωνικών, Οικονομικών και Πολιτικών Επιστημών, Πολεοδομίας, Αρχιτεκτονικής, Αρχαιολογίας, Γεωγραφίας, Περιβάλλοντος, Ιατρικής, Ψυχολογίας, Νοσηλευτικής και Κοινωνικών Λειτουργών, Καλών τεχνών, Νομικής και Διοίκησης της ημεδαπής ή αντίστοιχων ΑΕΙ της αλλοδαπής ή Πτυχίο ΤΕΙ