Το Τμήμα Κτηνιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας σε σύμπραξη με το Τμήμα Ιχθυοκομίας - Αλιείας του Τ.Ε.Ι. Ηπείρου οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών (ΠΜΣ) με τίτλο "Παθολογικά Προβλήματα Εκτρεφόμενων Υδρόβιων Οργανισμών".
Δεκτοί στο ΠΜΣ γίνονται Πτυχιούχοι ΑΕΙ Κτηνιατρικής, Γεωπονίας (Ζωικής παραγωγής), Βιολογίας και συναφών αντικειμένων, Βιολογικών εφαρμογών, ομοταγών Ιδρυμάτων του εξωτερικού, πτυχιούχοι ΤΕΙ: Ιχθυοκομίας-Αλιείας, Υδατοκαλλιεργειών, Ζωικής και Φυτικής παραγωγής και άλλων εφαρμοσμένων επιστημονικών κλάδων.