Το Τμήμα Κτηνιατρικής της Σχολής Επιστημών Υγείας του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας σε σύμπραξη με το Τμήμα Ιχθυοκομίας - Αλιείας του Τ.Ε.Ι. Ηπείρου οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών (ΠΜΣ) με τίτλο "Υδατοκαλλιέργειες".
Δεκτοί στο ΠΜΣ γίνονται Πτυχιούχοι ΑΕΙ Γεωπονίας, Κτηνιατρικής, Βιολογίας, Βιολογικών εφαρμογών, Ζωικής παραγωγής, Δασολογίας, Χημείας, Περιβάλλοντος και άλλων εφαρμοσμένων επιστημονικών κλάδων ομοταγών Ιδρυμάτων του εξωτερικού, πτυχιούχοι Πολυτεχνικών και Οικονομικών σχολών, Πτυχιούχοι ΤΕΙ Ιχθυοκομίας-Αλιείας, Υδατοκαλλιεργειών, Ζωικής και Φυτικής παραγωγής, Οικονομίας, Τεχνικών και άλλων εφαρμοσμένων επιστημονικών κλάδων.