Το Μ.Π.Λ.Α. απονέμει Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης και Διδακτορικό Δίπλωμα στη γενική περιοχή ανάμεσα στη Λογική και τη Θεωρητική Πληροφορική. Το Πρόγραμμα οργανώνεται από τα Τμήματα Μαθηματικών, Μεθοδολογίας, Ιστορίας και Θεωρίας της Επιστήμης, Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών του Πανεπιστημίου Αθηνών, τη Σχολή Εφαρμοσμένων Μαθηματικών και Φυσικών Επιστημών και τη Σχολή Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών του Εθνικού Μετσόβιου Πολυτεχνείου και το Τμήμα Μηχανικών Η/Υ και Πληροφορικής του Πανεπιστημίου Πατρών. Το γνωστικό αντικείμενο του Μ.Π.Λ.Α. είναι μια δυναμική περιοχή έρευνας και διδακτικής που στηρίζεται (περίπου σε ίσα μέρη) από τα Μαθηματικά, τη Λογική και την Πληροφορική, και, αντιστρόφως, προσφέρει μαθηματική θεμελίωση και εφαρμογές και στις τρεις αυτές επιστήμες.
Στο Πρόγραμμα γίνονται δεκτοί πτυχιούχοι Τμημάτων Μαθηματικών, Πληροφορικής και Μηχανικών Υπολογιστών των Πανεπιστημίων της ημεδαπής ή αντίστοιχων Τμημάτων της αλλοδαπής, καθώς και πτυχιούχοι άλλων Τμημάτων Σχολών Θετικών Επιστημών και Πολυτεχνικών Σχολών Πανεπιστημίων. Επίσης γίνονται δεκτοί και απόφοιτοι ισότιμων Τμημάτων συγγενούς γνωστικού αντικειμένου της ημεδαπής ή της αλλοδαπής από θετικές ή τεχνολογικές κατευθύνσεις.