Το Τμήμα Μαθηματικών της Σχολής Θετικών Επιστημών του Πανεπιστημίου Αιγαίου οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) στην "Μαθηματική Μοντελοποίηση στις Φυσικές Επιστήμες και στις Σύγχρονες Τεχνολογίες".
Δικαίωμα υποβολής αιτήσεων έχουν οι πτυχιούχοι Θετικών, Πολυτεχνικών και Οικονομικών Σχολών Α.Ε.Ι. της ημεδαπής ή ισότιμων αναγνωρισμένων της αλλοδαπής καθώς και πτυχιούχοι σχολών Τ.Ε.Ι.