Το Τμήμα Μαθηματικών του Πανεπιστημίου Αθηνών οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) στην Κατεύθυνση των Εφαρμοσμένων Μαθηματικών.
Δικαίωμα υποβολής αιτήσεων έχουν οι πτυχιούχοι Τμημάτων Μαθηματικών, Στατιστικής, Τμημάτων Σχολών Θετικών Επιστημών και Πολυτεχνικών Σχολών, Α.Ε.Ι. της ημεδαπής ή αντιστοίχων Τμημάτων της αλλοδαπής, καθώς και πτυχιούχοι αντιστοίχων τμημάτων Τ.Ε.Ι. της χώρας.