Το Τμήμα Οικονομικών Επιστημών του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) με τίτλο "Οικονομική Θεωρία και Πολιτική" με κατευθύνσεις
Δεκτοί στο ΠΜΣ γίνονται απόφοιτοι Τημάτων Οικονομικής κατεύθυνσης ή ομοειδή Τμήματα, καθώς επίσης και σε πτυχιούχους Τμημάτων Θετικών Επιστημών, Πολυτεχνικών Σχολών και Στρατιωτικών Σχολών των ΑΕΙ της ημεδαπής ή αναγνωρισμένων Τμημάτων της αλλοδαπής.