Το Τμήμα Μηχανικών Πληροφοριακών και Επικοινωνιακών Συστημάτων του Πανεπιστημίου Αιγαίου οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) στις "Τεχνολογίες και Διοίκηση Πληροφοριακών και Επικοινωνιακών Συστημάτων" στις κατευθύνσεις
Στο πρόγραμμα θα γίνουν δεκτοί πτυχιούχοι Πανεπιστημιακών Τμημάτων Πληροφορικής ή Μαθηματικών ή Φυσικών ή Οικονομικών, ή διπλωματούχοι Πολυτεχνικών Σχολών, της ημεδαπής ή ισότιμων αναγνωρισμένων της αλλοδαπής.