Το Τμήμα Βαλκανικών, Σλαβικών και Ανατολικών Σπουδών του Πανεπιστημίου Μακεδονίας οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών με τίτλο «Πολιτικές & Οικονομικές Σπουδές Σύγχρονης Ανατολικής & Νοτιοανατολικής Ευρώπης».
To Π.M.Σ. απευθύνεται σε πτυχιούχους ελληνικών και αλλοδαπών Πανεπιστημίων (αναγνωρισμένων και ισότιμων προς τα ημεδαπά) με έμφαση στους τομείς που καλύπτει το Π.M.Σ., καθώς και άλλων τμημάτων ΑΕΙ και ιδρυμάτων τριτοβάθμιας εκπαίδευσης.