Το Παιδαγωγικό Τμήμα Δημοτικής Εκπαίδευσης του Πανεπιστημίου Κρήτης οργανώνει και λειτουργεί Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) με τίτλο «Επιστήμες της Αγωγής».
Στο ΠΜΣ γίνονται δεκτοί οι πτυχιούχοι Τμημάτων όλων των Ελληνικών Πανεπιστημίων. Δεκτοί γίνονται επίσης οι πτυχιούχοι των παραπάνω Τμημάτων Πανεπιστημίων της αλλοδαπής.